조바 조바

Fastq파일 QC → adapter or low quality sequence trimming까지 마쳤다면 이제 본격적으로 분석을 시작할 준비가 되었다. 유전자들의 발현을 정량화 시키는 것이 RNA-seq의 목적이다. 하지만 아직 transcript들을 한 번에 시퀀싱 하는 기술이 없어 transcript들을 단편화 시켜 라이브러리를 제작해주고 시퀀싱을 했었다. 이렇게 완성된 fastq 파일들의 QC, adapter or low quality sequence trimming을 마친 후 이제 단편화 시켜줬던 transcript 조각들이 어떤 transcript로부터 유래했는지 역으로 추측해보는 과정을 해야 한다. 이 과정은 단편 조각들을 서로 이어 붙여보면서 trasncript의 서열을 추론하는 방식(A..