fastqc
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Fastq 파일 구성 및 QCTranscriptome Re-seq 2021. 3. 7. 18:31
시퀀싱작업을 마치고 각각의 리드들의 nucleotide sequence들에 대한 정보를 fastq 파일 형태로 만들어 준다. fastq파일은 리드 하나당 네 줄에 걸쳐서 정보를 표현하는데 그 예시는 다음과 같다. 더보기 @SEQ_ID GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT + !''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65 Line 1 : '@'로 시작하며 리드의 id 정보와 index 서열 정보를 표시한다. 리드 정보를 통해 Paired-end 리드의 경우 리드1, 리드2 정보를 알 수 있고 시퀀서에 들어가는 flowcell의 어느 위치에서 시퀀싱이 됐는지에 대한 정보를 알..