rna-seq
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RNA-seq 라이브러리 제작Transcriptome Re-seq 2021. 3. 7. 18:02
RNA-seq의 리드는 long read, short read 두 종류로 나눌 수 있다. long read가 short read에 비해 유리한 것이 더 많지만 가장 큰 장점은 시퀀싱된 리드가 어떤 splicing variant에서 유래 했는지 더 잘 유추할 수 있다는 점이다. 때문에 splicing variant분석에 더 유리하다. 하지만 아직까지는 long read 방식은 비용도 비싸고 short read에 비해 정확도가 떨어지기 때문에 아직까지 short read 시퀀싱 방식이 많이 사용되고 있다. (Amarasinghe, Shanika L., et al. "Opportunities and challenges in long-read sequencing data analysis." Genome biol..